งานตรวจสอบภายใน เป็นหน่วยงานที่จัดตั้งขึ้นตามมติคณะรัฐมตรี ปี 2519 ที่กำหนดให้ทุกกระทรวง ทบวง กรม จะต้องจัดตั้งหน่วยงานตรวจสอบภายใน เพื่อทำหน้าที่ตรวจสอบงานด้านการเงิน ที่แต่ละหน่วยงานได้รับจัดสรรงบประมาณมาในแต่ละปี ให้โปร่งใสและสามารถตรวจสอบได้ โดยกำหนดให้ผู้ตรวจสอบภายใน จะต้องมีคุณวุฒิชั้นต่ำปริญญาตรีทางการบัญชีหรือพานิชย์ศาสตร์

กรมตำรวจจึงได้จัดตั้งหน่วยตรวจสอบภายในขึ้น เมื่อ ปี พ.ศ. 2528 โดยใช้ชื่อหน่วยงานว่า "งานตรวจสอบภายใน" เป็นหน่วยงานที่ยังไม่มี พระราชกฤษฎีการองรับ เป็นเพียงกลุ่มตำแหน่งที่จัดตั้งขึ้นเท่านั้น มีหัวหน้าหน่วยงานเป็นระดับ รอง ผบก. ใช้คำย่อว่า "รอง ผบก.ตส." โดยกรมบัญชีกลาง เป็นหน่วยกำหนดระเบียบขอบเขต อำนาจหน้าที่และการกิจให้ผู้ตรวจสอบภายในของแต่ละกระทรวง ทบวง กรม ถือเป็นแนวทางปฏิบัติ

ปี พ.ศ. 2532 กรมตำรวจได้ปรับตำแหน่งหัวหน้างานตรวจสอบภายใน เป็นระดับ ผบก. ในตำแหน่ง ผบก. ประจำ ดร. (ทำหน้าที่ หัวหน้าตรวจสอบภายใน)

ปี พ.ศ. 2548 กรมตำรวจได้ยกฐานะตำแหน่งหัวหน้าตรวจสอบภายใน เป็นระดับ ผบช. ในตำแหน่ง ผบช. ประจำ ตร. (ทำหน้าที่หัวหน้าสำนักตรวจสอบภายใน) ใช้ชื่อหน่วยงานว่า "สำนักตรวจสอบภายใน"

จนกระทั่งปี 2552 สำนักงานตำรวจแห่งชาติได้มีการปรับโครงสร้างใหม่ จึงได้ จัดตั้ง 

"สำนักงานตรวจสอบภายใน" เป็นหน่วยงานในสังกัดสำนักงานตำรวจแห่งชาติ มีฐานะเทียบเท่ากองบัญชาการ ตามพระราชกฤษฎีกาแบ่งส่วนราชการสำนักงานตำรวจแห่งชาติ พ.ศ. 2552 ซึ่งมีผลบังคับใช้ตั้งแต่วันที่ 7 กันยายน 2552 เป็นต้นมา

จึงกำหนดให้วันที่ 7 กันยายน ของทุกปี

เป็นวันคล้าย "วันสถาปนาสำนักงานตรวจสอบภายใน" อย่างเป็นทางการ